Det hele starter med oprettelsen af en grundtvigsk friskole i 1887.

Denne første friskole blev med tiden del af et skolekompleks, hvor der gennem årene har været både børneskole, efterskole, højskole, håndværkerskole og lærerskole.

I 1906 etableres Elbæk Fri- og Efterskole og der køres med kombineret skole- virksomhed indtil 1966.

I 1967 indstilles friskolevirksomheden, hvorefter skolen fortsætter som efterskole.

Skolens navn har siden 1967 været Elbæk Efterskole.